早上起来腰疼的情况可以因为腰肌劳损，这种情况可以因为工作以及不良的生活习惯造成腰肌僵硬、钙化、粘连，在早上起来会出现酸胀不适。夜间因为活动减少、血循环差，使炎症物质积聚，刺激僵硬钙化的部位，在晨起时或刚开始活动时会出现腰疼，是一大特点。在活动一段时间以后，腰疼会有所缓解，劳累以后又会疼痛加重。
腰疼还和年龄增大以后的骨质疏松、增生有关系，小关节和骨质有增生、僵硬、钙化，从而出现局部的磨损，出现刺激神经以后的疼痛。腰疼还是要注意有没有骨科的慢性疾病，像强直性脊柱炎、骶髂关节炎，包括椎间盘突出，刺激到皮神经、返神经，在晨起时都会出现腰部的僵硬和疼痛。
早上起来腰疼，还要注意有没有腹痛、尿急、尿痛等情况。胃肠道的炎症和泌尿系的结石、感染，也会造成晨起时腰疼加重，需要对症检查清楚以后进行治疗。