跑步以后小腿疼痛需要暂时减少活动，抬高患肢，进行休息。可以进行一定轻微的拉伸放松，延缓肌肉的疲劳，同时如果疼痛严重，需要进行一定的药物治疗，包括外喷的喷剂、贴膏药或者用一些中草药进行外洗和熏蒸。
如果仍然疼痛严重，可以口服一些非甾体类的消炎镇痛药，减轻炎症的积聚、减轻局部疼痛。使肌肉痉挛得到放松一些活血化瘀、舒筋散寒的中成药也有好处，像一些局部淤血减轻的药物。
跑步之后小腿疼痛经过保守和休息以后，大部分能够缓解。如果仍然疼痛非常严重或者有肿胀，就需要去相关医院检查清楚。特别是检查一下磁共振，看有没有韧带的损伤、肌肉的拉伤以及淤血等情况。如果不太严重，请有经验的医师进行康复训练，针灸、按摩也有好处。如果确实非常严重，需要检查清楚以后，根据损伤的情况对症治疗。