对于脾胃虚寒导致的急、慢性消化系统疾病的患者，要慎用蕨菜。蕨菜属于寒性的蔬菜，有胃肠道疾病的患者食用之后，可能会导致胃肠部不适，有些患者甚至会出现腹痛、腹泻的症状。
长期食用蕨菜具有降低血压的作用，所以对于血压偏低的患者，避免进食蕨菜。蕨菜中的某些成分，容易导致人发生过敏反应，所以有过敏体质的患者，谨慎食用蕨菜。
蕨菜内含有少量的致癌物质，所以平时适当的服用。食用蕨菜时候，适当进行加工，将有害的物质去掉。