腱鞘囊肿一旦确诊以后，大部分需要进行抽液，然后注射药物或者手术治疗才能治疗好，很难自愈。
有一些腱鞘囊肿比较小，需要经过休息制动以后，有可能会有自己消散。如果想自愈，需要注意休息。同时囊肿比较小的情况下，手部需要减少手指、手腕的活动，避免劳累、受凉、提重物等。脚部需要避免穿高跟鞋，避免久站走路过多，同时可以根据局部囊肿的情况进行一定的消肿止痛药物治疗。
一般经过休息，如果能逐渐缓解，可能会自愈。但是绝大部分还是会在劳累或者不良姿势以后会继续发展，逐渐增大。如果对局部没有明显的疼痛或者影响生活工作，可以继续观察。如果非常严重，就要进行一定的处理，包括手术。