乙肝大三阳是会转变成乙肝小三阳的。
乙肝的自然病程分为四个时期，免疫耐受期、免疫清除期、低复制期和再活动期。在免疫耐受期时，患者往往是乙肝大三阳，病毒载量很高。患者乙肝进入到免疫清除期时，患者的病毒量出现下降，转氨酶出现波动。随后进入到低复制期时，患者往往会转化成乙肝小三阳。这时病毒载量低，肝功能正常，肝脏病理炎症活动轻微或者无炎症表现。
乙肝大三阳的患者，经过积极有效的抗病毒治疗，也可以实现大三阳向小三阳的转化。如抗病毒使用α-干扰素或者口服核苷酸类似物治疗有效时，均会大三阳向小三阳转化。