趴着睡后腰疼，一般都和局部的腰肌有扭伤、炎症渗出或者有慢性的腰肌劳损，本身腰部的竖脊肌棘突和韧带，有一定炎症刺激，在趴着睡姿势不良时，容易加重这种刺激；或者因为有局部床铺太软，睡觉时周围有潮湿阴冷。
还可能因为骨科的一些慢性疾病，本身年龄增大以后，退行性变，骨质疏松，并且会有慢性的隐痛，严重时造成了腰椎间盘突出、椎管狭窄、关节炎等，这些都会造成腰部的疼痛。
趴着睡腰疼，还要注意有没有伴随着腹痛、恶心、尿急、尿痛等情况。排除一些胃肠道炎症或者泌尿系炎症刺激引起的放射痛，对症检查清楚以后，进行治疗。