肛瘘流脓严重有两种方法可改善：
一、是应用抗菌药物，配合肛门熏洗坐浴，外用药物治疗，流脓会逐渐减轻改善。
二、是手术治疗，手术治疗可以治愈肛瘘，肛瘘治愈流脓就会消失。
流脓是肛瘘的主要症状，新形成的肛瘘流脓较多，脓稠、味臭，以后脓液会逐渐减少，有时外口闭合，脓液会在外口处积聚，形成脓肿，会出现肿胀、疼痛。应用抗菌药物治疗，暂时流脓减少，会反复发作，经久不愈，只有手术治疗才能治愈肛瘘流脓。