手背腱鞘囊肿的治疗，需要根据囊肿的大小，以及引起的症状，来进行综合的评估治疗。
如果囊肿比较小，没有引起明显的疼痛，可以不用特殊的治疗。平时多注意休息，避免手部过度的活动，减少对肌腱及腱鞘刺激，避免囊液的渗出，多注意观察，部分的腱鞘囊肿可能会自愈。
如果腱鞘囊肿生长过快，压迫周围的组织，可能会导致疼痛、手背的麻木、活动受限。需要及时去正规医院的骨科就诊，由专业医生进行穿刺抽液，注射曲安奈德以促进囊液的吸收。也可以采取手术完整切除囊肿和囊璧，术后也要多注意观察，注意劳逸结合，防止出现复发。