肛门里面疼痛可以考虑以下原因：
1.内痔的痔核增大和脱出。当发生内痔的痔核增大或脱出的时候，可以由于局部组织的受压力位移而出现明显的疼痛感。如果脱出较为严重，可以从外观以及触摸上感觉到脱出痔核的存在。大多有典型的痔疮表现，例如排便时伴有鲜血，擦便时带血，以及肛门坠胀感。
2.肛裂。常常发生于便秘的情况下，也可以由于短期腹泻频繁排便所导致。症状有排便时有鲜血滴落，同时有撕裂样或刀割样的剧痛发作于肛门内。
3.肛窦炎急性期。慢性肛窦炎常常只有肛门不适感和坠胀感等感觉，但在急性期发作的时候，可以伴随炎症出现明显的疼痛和便血。