跑步的时候肚子痛，可考虑是以下因素引起的：
1.肠梗阻的患者在跑步时，会出现肚子疼痛的症状。是因为运动的时候人体的血液会被重新分配，消化道暂时性地缺血，可能引起胃肠道的平滑肌痉挛，患者会出现明显的腹部疼痛。跑步的过程中会引起胃肠道震动，肠系膜受到牵拉，也是引起腹部疼痛的主要原因。
2.腹腔感染的患者，会引起明显的腹部疼痛。患者在跑步的时候，呼吸不均匀、胸腔内的负压减小、肝脏的回流受阻，患者也会出现腹部疼痛的症状。