跑步时肚子痛可以考虑和腹部震动有关，另外也不排除和患者存在腹腔内脏器器质性疾病有关。
如果患者跑步时出现了轻微腹痛症状，休息后疼痛症状消失，多考虑属于生理现象，是因为跑步时引发的震动牵扯到腹壁，或者脏器神经而引发的临床表现。
如果患者腹痛症状较为明显，不排除是因为致病因素的刺激，导致腹腔脏器神经敏感度升高，当跑步时会再次刺激到敏感神经，使得疼痛症状加重。这种情况下需要及时去医院检查确诊。