肛门上的肉肿起很疼，考虑是以下情况：
1.炎性外痔或血栓性外痔，这两种痔疮都会引起肛门强烈疼痛。炎性外痔多容易继发于肛门黏膜炎性反应感染和损伤等原发因素，颜色大多以红肿为主。血栓性外痔是黏膜小静脉曲张，或者肛门处静脉破裂、血块凝集所导致，颜色常见青紫色或紫红色，以及暗紫色。这两种痔疮从感受很难鉴别，主要从外观表现判断。
2.肛周脓肿。肛周脓肿主要是由于直肠内部的炎症、感染，波及肛腺所导致。肛腺分泌物由于重力因素，下流蓄积的时候会出现肛门处皮肤凸起和剧烈性疼痛，凸起大多有波动感，疼痛呈跳动样。