当患者存在轻微肛瘘的现象时，在临床上通常不会有明显的症状，部分较为敏感的患者可能会有隐约的肿胀的感觉，以及治疗以后患者肛瘘的现象即可以逐渐减轻，病变部位也会逐渐恢复正常。
当患者不及时进行治疗或并未在意，使病情出现进一步发展的趋势以后，患者可能会由于炎症或者感染出现，而感觉到病变部位有疼痛以及瘙痒的现象。当瘙痒较为剧烈时，可能会对患者的日常生活和工作造成影响。
因此，在出现肛瘘以后，建议患者应尽快前往正规医院肛肠科进行治疗，避免病情加重，使患者出现明显的临床症状。