早上起来腰酸痛的原因，最常见的是因为腰肌的慢性劳损。
这种情况本身因为不良姿势，或者年龄增、大劳累等，会造成腰肌有僵硬、钙化，在夜间休息时炎症物质渗出，同时血液循环差，会在早上起来时刺激神经出现腰部的酸痛不适，特别是刚起床时。经过一定的活动，血液循环恢复会逐渐地好转，但是在劳累或者受凉情况下，又会明显刺痛。
要注意年龄增大以后，骨质疏松、增生，有骨的强度、密度减低，也会在早上醒来时伴随着疼痛。同时，要注意一些慢性疾病，像骶髂关节炎、强直性脊柱炎、风湿等，也会造成韧带、骨质的破坏，在早晨晨起时会有僵硬和疼痛，需要检查清楚以后对症治疗。