急性肺脓肿多是由于病原菌感染造成，而急性肺脓肿又分为血源性肺脓肿、继发性肺脓肿、吸入性肺脓肿等。
引起血源性肺脓肿的致病菌一般是金黄色葡萄球菌、链球菌等病原体感染，造成脓毒栓子通过小循环带至肺部中，造成小血管栓塞，引起肺部发炎坏死，从而形成血脓性肺脓肿。
而继发性肺脓肿多是铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯杆菌等病原菌侵入机体，诱发空洞型肺结核、支气管扩张等疾病，由于肺部邻近器官化脓性疾病出现病变或者是外伤感染等，可穿破肺部，诱发继发性肺脓肿。
若机体受到需氧菌、厌氧菌的侵袭，通过口、鼻、咽喉等部位吸入到肺部，造成支气管阻塞，病原菌可在肺部繁殖，可诱发吸入性肺脓肿。
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