胰腺囊肿可以分为真性囊肿、假性囊肿和囊性肿瘤，由先天或后天因素引起。真性囊肿包括先天性单纯囊肿、多囊病、皮样囊肿、潴留囊肿等，囊肿内壁覆有上皮。囊性肿瘤有囊性腺瘤和囊性癌。
假性囊肿的囊壁为纤维组织构成，不覆有上皮组织，临床上胰腺囊肿以假性囊肿最多见。其中，真性囊肿和假性囊肿都属于胰腺的良性肿瘤，不会传染和扩散。而囊性肿瘤中，囊性腺瘤也属于良性肿瘤，虽然具有一定的恶变几率，但概率极小。
而囊性癌属于恶性肿瘤的范畴，癌细胞可以出现转移或扩散。