十二指肠溃疡的患者由于十二指肠黏膜受损，胃酸分泌多会出现上腹部疼痛、胀痛，特别是在饥饿时疼痛会明显，这种疼痛是位于剑突下，进食后可减轻，大部分的患者疼痛会有出现规律性。
反流性食管炎是由于食管黏膜受到反流物的刺激出现炎症，患者会出现反酸、烧心、胸痛症状。烧心痛出现在胸骨或者胸骨后背，还会伴随有消化不良的症状，当食管壁增厚，管腔变狭窄时，还会出现有吞咽困难。
要准确区分十二指肠溃疡和反流性食管炎，结合临床症状，到医院消化内科做相关的电子内镜就可以确诊。