在临床当中导致患者醒来出现头疼的原因很多，主要可分为以下几种：
1.脑供血不足造成。如果患者既往患有脑动脉粥样硬化，睡觉过程中血流减慢，可能会引起大脑缺血、缺氧。所以，在醒来后容易出现头晕、头疼的表现。
2.醒后出现头疼，还有可能是血压升高引起，尤其是在清晨容易出现高血压，引起头晕、头疼的表现。建议患者监测血压，规律服用降压药。
3.醒后头疼还有可能是睡眠呼吸暂停综合征造成。在睡眠过程中由于经常打鼾、呼吸暂停，导致大脑缺氧，会引起醒来头疼的症状。