一睡醒头就疼的原因有很多，首先需要考虑是睡眠质量欠佳，例如睡眠时间不够或者睡眠时间过长，都有可能导致在睡醒后出现头疼的现象。这种头疼往往是功能性的头痛，一般在去除诱因充分休息后，症状可有所缓解。
其次，需要考虑夜间睡觉后，受凉感冒导致头疼的现象，往往还会伴随咽喉肿痛、四肢酸痛、打喷嚏、流鼻涕等感冒症状。
另外，有高血压基础疾病的患者，睡醒后出现头疼的症状，需要立即监测血压情况。高血压具有晨起后血压升高的情况，由于血压升高会引起脑血管扩张，也会出现头疼的症状。