Ⅰ型和Ⅱ型呼吸衰竭的区别，主要在发病机理上是不同。
Ⅰ型呼衰也称为低氧血症性呼吸衰竭，多是因为肺的换气功能不足而导致的。此时患者血气分析提示氧分压小60mmHg，不伴有二氧化碳分压升高。
而Ⅱ型呼吸衰竭称为高碳酸血症性呼吸衰竭，是因为肺的通气功能衰竭而导致的。患者此时血气分析提示二氧化碳分压大于等于50mmHg，伴或不伴有氧分压小于60mmHg。
此外治疗上也有一定的区别，Ⅰ型呼吸衰竭多需要予以高浓度吸氧。而Ⅱ型呼吸衰竭多需要低流量低浓度吸氧，避免因高浓度吸氧而导致其出现肺性脑病，使病情加重。当然两者治疗效果不佳时，均需要予以呼吸机的辅助呼吸治疗。