目前对于肝内胆管结石尚无特效药物治疗，中医治疗以清肝利胆为主，有一定临床作用，西药多采用去氧胆酸、鹅去氧胆酸，对胆管结石的形成有一定阻止作用。
临床上对于胆结石的治疗，主要是根据症状的对症处理，比如疼痛发作时予以6542或间苯三酚，恶心呕吐则予以奥美拉唑，炎症发作就要用到抗生素等。
同时建议患者改变不良生活习惯，改变生活节奏，每日三餐定时尤其早餐，生活作息规律，避免熬夜，少吃油腻、动物性食物，多吃素食，对预防胆结石具有重要的意义。