鼻咽癌的发生通常认为和EB病毒的感染有关。在鼻咽癌的组织中也检测到了EB病毒核酸和EB病毒的抗原。
EB病毒通常分为A型和B型两个亚型。有研究认为，大部分的鼻咽癌是EB病毒A型感染导致的。而EB病毒的B型仅仅在霍奇金淋巴瘤，或者非霍奇金淋巴瘤中被发现。所以研究认为，降低A型EB病毒感染的几率就有可能会降低鼻咽癌的发病率。
当然，诱发鼻咽癌除了EB病毒感染本身之外，还会有其他的多种因素的参与。一般情况下，EB病毒可能导致鼻咽癌发生的时间需要20~30年的时间。