肝包虫病的病情有轻重之分，对于大部分的肝包虫病，是可以通过有效治疗达到改善病情，治愈疾病的目的。
但是如果疾病没有得到及时有效的治疗，病情发展到晚期，造成严重的肝功能和其他脏器的损害，那么治疗难度也会非常大，甚至有可能导致死亡。
目前对于肝包虫病的治疗，主要以手术为主。保守治疗主要是服用驱虫药物如阿苯达唑胶囊、阿苯达唑片、吡喹酮片等。手术治疗需要根据病变的范围，病变的程度选择相应的手术方案。手术原则是清除内囊，防止囊液外溢，同时消灭残腔。