肝功能不全与肝损伤其主要区别是两者的病因不同。
肝功能不全多半是由于某些病因破坏肝细胞而导致毒素在体内堆积造成的疾病。而肝损伤比较常见的病因是由于病毒性肝损伤或者酒精性肝损伤造成，也就是多半由于患者服用药物或者不良生活习惯导致。
这两者的症状都极为相似，但是在临床检查中会出现一定的区别，通常肝损伤可依靠药物进行治疗，也就是适当服用保肝药物或者抗病毒药物进行缓解。而肝功能不全则需进行免疫抑制治疗以及代谢调和剂进行治疗。