睡醒了头疼，多考虑可能与睡眠质量有关。
如果在睡觉的过程当中频繁做噩梦，难以进入到深睡眠状态，或者是存在不安腿综合征、睡眠呼吸暂停综合征，导致睡觉时频繁醒来，致使整晚的睡眠时间不足，就容易在睡醒后出现头痛症状。也可能是由于睡觉前大量喝浓茶、咖啡等刺激性的饮品，导致脑部血管扩张，对头部神经产生刺激，继而引起睡醒后头痛。
如果睡醒后头痛，同时伴有咳嗽、流鼻涕或发烧等症状，多考虑可能是由于睡觉时没有注意保暖，导致受凉感冒，而引起的睡醒后头痛。