胰腺结石的手术根据胰腺结石的大小、位置、以及胰管的狭窄程度，需要采取不同的手术方案，任何手术均会有一定的风险，手术方式包括：
1.内窥镜取石：此法仅用于胰管无狭窄的胰石。
2.胰腺部分切除：指结石局限于胰体、胰尾的多块结石，并且该部胰腺毁坏较为严重者。
3.胰实质切开取石：适应于胰头、体部结石，并伴有胰管多处狭窄者。
4.Whipple手术：适应于胰头部多发性结石、胰头而毁坏或有恶变者。内镜手术创伤小、恢复快，但容易将消化道的细菌带到胰腺，产生胰腺炎。
其它手术方式均有可能导致出血、胰腺本身及周围器官的损伤，产生相应的并发症、术后胰瘘等。