严重功能性便秘者主要是通过改善平时的饮食和生活习惯来综合调理。
平时应养成规律饮食的良好习惯，尽量以清淡、易消化的饮食为主，在食材选择上，尽量多吃一些富含粗纤维的食物和新鲜的蔬菜水果，不要吃辛辣和油炸以及烧烤类食物。同时，还要保证每日充足的喝水量，避免身体缺水，造成大便干燥，加重便秘症状。另外，还要养成定时排便的习惯，最好是固定晨起排便，让人体形成一个生物钟。
也可以通过药物调理，适当给予使用促胃肠动力药，如莫沙必利等，或者是益生菌，或者是容积性泻药，以帮助排便。