对于感染肝包虫病的患者，除采用常规的驱虫及抗生素药物治疗外，为防止病情恶化，目前手术治疗仍是最主要的治疗手段。手术的原则是清除内囊，防止囊液外溢，消灭外囊残腔，预防感染。
具体手术方法依包囊大小、有无胆瘘和感染或钙化决定。术前可静脉滴注氢化可的松，以防术中囊液破溃入腹腔引起过敏性休克，手术方式需依据有无合并感染而定。
此外，肝包虫病的患者要注意个人卫生，养成良好的生活习惯，减少或避免与犬类以及牛羊接触，尽量少吃生菜。如有不适，及早就诊。