肝囊肿对人体的影响，因肝囊肿的大小、位置以及是否发生感染等因素而不同，通常囊肿较小者不会对人体造成病理性的影响。
临床上通常也没有症状，但当囊肿增大时，可出现肝大、右上腹不适、腹胀、腹部钝痛及腹部包块。
如果囊肿内并发感染，则有可能损害肝功，患者可出现发热、头晕、乏力、营养不良等相应症状。
如果肝囊肿处于肝的脏面且较大，可压迫胆管，造成肝功损害和黄疸，如压迫到门静脉，可造成门脉压力的增高，产生脾大、腹水、消化道出血等临床症状。