病毒性脑膜炎和乙脑的区别主要是病变的部位不同。病毒性脑膜炎的病变部位主要是在脑膜，而乙脑的病变部位主要是脑实质。除此之外，两种疾病在临床症状以及治疗手段上差别并不大。
病毒性脑膜炎和乙脑都是病毒感染造成的中枢神经系统感染性疾病。患者一般都会出现发热、剧烈头痛、恶心、呕吐、继发性癫痫、意识障碍、精神异常以及痴呆等症状。
所不同的是，病毒性脑膜炎会形成脑膜刺激征，而乙脑一般不会出现脑膜刺激征。在治疗上主要都是给予阿昔洛韦、更昔洛韦等抗病毒的药物治疗，同时还要给予营养支持以及对症治疗。