胆囊萎缩大多数都要切除治疗，具体可根据个人实际情况来决定。
若是因先天性胆囊发育异常导致的胆囊萎缩，情况比较轻微时身体没有异常症状，且未出现结石、炎症，可以暂时性观察，根据后续的情况来决定是否要切除。
若是因胆囊结石频繁刺激胆囊壁，导致局部出现炎性变化而引起的萎缩，此时表明胆囊里可能已经全部是结石，胆囊壁增厚过多，胆囊功能受损严重或已经完全失去原本的功能，此时建议患者要尽快采取外科手术方式切除治疗。尤其是慢性胆囊炎所致，情况严重时可能会导致胆囊癌变。