消化不良伴有腹泻，主要是因为肠道的蠕动亢进所引起。
因为存在消化不良的患者胃内的食物无法及时消化，食物会对胃部黏膜造成刺激，引起胃酸分泌多，会刺激肠道蠕动增快，肠道无法充分吸收食物的营养、水分从而出现腹泻。
可以适当服用促进胃动力的药物，比如莫沙必利、多潘立酮增强胃的动力，以及结合四磨汤口服液、乳酸菌素片等增强胃动力。促进消化，并要适当服用肠道微生态制剂，比如布拉氏酵母菌。如腹泻较为严重需服用止泻的药物，比如蒙脱石散，综合治疗才能缓解消化不良伴有的腹泻。