胆管结石的手术，需要根据结石的部位、数量、大小的不同选择相应的手术方式。
手术治疗的原则是术中尽可能取尽结石，解除胆道狭窄和梗阻，去除感染病灶。术后需要保持胆汁引流的通畅，预防胆石再发。
常见的胆囊结石手术方式包括，传统方法的开腹切除术，一般用于肠黏连症状较重的患者，目前临床上多用的手术方式为腹腔镜下胆囊切除术。胆管结石的手术方式包括胆总管切开取石加T管引流术、胆肠吻合术、Oddi括约肌成形术。除此之外，其他的治疗包括体外冲击波碎石、体内接触碎石，即经内镜微创手术取石碎石等。