水土不服时每个人的临床表现是不一样。
部分人可以表现出腹痛、腹泻、呕吐等胃肠道症状。也有人表现出失眠多梦、胸闷、气短等症状，还有一部分人则以过敏反应为临床表现。
水土不服的产生，往往是由于离开熟悉的环境到新的地方，因生活习惯、环境等变化而引起的身体不适，而这些不适的严重程度也是不一样。绝大多数的人群水土不服症状，由于逐渐适应多能逐渐缓解。部分症状明显的患者，则需给予药物对症治疗方能缓解。