水土不服头疼可以通过服用以下药物缓解症状：
首先，水土不服多是由于离开经常生活的环境，前往其他地方出现了恶心、乏力、腹泻、头疼、焦虑等不适感。当因为水土不服引起头疼的症状，可以服用镇脑宁类的药物促进症状缓解。
其次，也可以多补充维生素类的药物，尤其是补充维生素B、维生素C等。能够很好改善水土不服引起的头疼等相关症状。
此外，当由于水土不服导致头疼，还可以通过服用藿香正气软胶囊，缓解头疼等不适感。如果头痛的症状不缓解，可以通过服用非甾体类抗炎药缓解疼痛，严重头疼者也可以及时就医，明确诊断。