双侧基底节区腔隙性脑梗塞是否严重，主要和脑梗塞的发生时间、梗死病灶数量和大小等因素有关。但既然是腔隙性脑梗死，梗死的病灶比较小，一般都不太严重，更不会危及生命。
如果双侧基底节区腔梗是陈旧性脑梗一般不严重，可能会出现一些轻度头晕、头痛、肢体无力，或者笨拙表现。
如果发作的时间比较近，有可能出现比较严重的情况。首先，双侧脑神经有可能受到损伤，还有可能对患者的智能造成一定影响，表现为反应迟钝、言语不清、计算力和定向力差。
双侧的基底节都可能会累及皮质、脊髓束和皮质脑干束，可能引起运动和感觉功能受损，有可能出现轻度的肢体运动功能异常。