导致便秘的病因很多，按照检查结果总体上，可以分为器质性和功能性便秘。器质性便秘是由于有基础的器质性疾病存在，导致的便秘发生，包括肠道和腹腔脏器的很多疾病都可以引起便秘，常见的有：
1.动力性疾病。如肠道神经、肌肉病变、先天性巨结肠等。
2.炎症性病变。如克罗恩病、肠结核、溃疡性结肠炎等。
3.肠道肿瘤。如结直肠癌。
4.肠外疾病。如前列腺癌、子宫肌瘤等。
5.系统性疾病。如甲状腺机能减退、糖尿病、风湿免疫类疾病、脊柱损伤、帕金森病等。
6.药物因素。包括吗啡、精神类、钙通道阻滞剂、抗胆碱能药物等。
功能性便秘是进行腹腔和肠道检查，没有发现器质性疾病，但是病人存在便秘的症状，多与饮食、生活、排便习惯有关。功能性便秘分为正常传输型便秘、慢传输型便秘、排粪障碍和直肠排出障碍。