造成胆结石的原因包括先天性的胆道狭窄、后天的感染，以及女性激素、肥胖、妊娠、高脂肪饮食、长期肠外营养、糖尿病、高脂血症、胃切除或胃肠吻合手术后、回肠末段疾病或回肠切除术后、肝硬化、溶血性贫血等。
手术取石目前是肝内胆管结石的根治性治疗方案，手术方案包括胆总管切开取石，肝脏部分切除，病情严重的需要进行肝移植等。
手术虽然是胆结石治疗过程中最有效的手段，但是如果患者术后不注意护理，造成了胆道系统的再次感染。饮食结构不合理，饮食习惯较差，或其它造成胆结石的疾病，没有得到有效治愈，都有可能造成结石的复发。