胆总管结石术后发炎发烧的原因有很多，一般发热是任何外科手术后最常见的并发症，通常是由手术创伤所引起的，因为手术本身就是一个损伤的过程，组织损伤会导致机体发热。
另外，胆总管结石术后一般需在体腔内放置t管引流，部分患者会出现排异反应或术后胆瘘，也是术后发热的重要原因之一。
除此之外，胆总管结石术后的发炎与术前的发炎致病原因并无二致，比如消化道细菌的逆行感染，人体手术过后，一般机体抵抗力较为低下，胃肠道功能恢复较慢，有可能导致胆管炎的复发等等。