跑步的时候右上腹突然刺痛这种情况，可能是因为运动引起的肠道功能紊乱或痉挛，属于生理性因素。
也可能是某些疾病被跑步诱发，这些疾病主要是肝胆和胰腺的病变，以胆结石和胰腺结石最为常见。比如一些比较小的胆囊结石或肝内胆管结石，在跑步时由于震荡掉入胆管或在原处活动，结石活动的过程会刺激到胆道黏膜，引起右上腹刺痛。
除了上述疾病外，各种类型的肝炎、胆囊炎和胆管炎、胰腺炎、胃肠炎症等，都有可能引起这种症状，因此需要根据实际情况来具体分析。