分水岭脑梗死可以留下后遗症，但是病灶特别小的分水岭脑梗死，比如腔隙性脑梗死可能不会留下明显的后遗症。
分水岭脑梗死可以发生在皮质和白质交界的地方，也可以发生在大脑前、中、后三个动脉供血区相交接的地方。这些部位都存在着大量的神经元细胞，它们的缺血、坏死，就会导致各种神经缺失症状。可能是肢体的运动不灵活、偏瘫、感觉异常、大小便失禁、视野缺损、认知功能障碍、情感障碍等。
具体是哪一种后遗症和后遗症的轻重程度，要看梗死面积的大小和梗死部位神经细胞的重要程度。