在通常的情况下，肛拭子采样以后会有一部分人感觉到肛门略微有所不适应的情况，都属于较正常的现象。
因为在做肛拭子的时候，会围绕着肛门进行棉签探头的探入，因此可能会对肛门周围的黏膜造成瘙痒等临床症状。有的人也有可能造成黏膜充血和水肿，因此会让人体有轻度不适应的情况。但是这种情况通常持续数分钟就会完全好转，并不会留有明显的后遗症或者典型的不适应的症状。
因此，肛拭子采样以后不用过分紧张，也不需要过度担心，肛拭子的采样是针对隔离人群和重点防护者、密切接触者。