肛拭子采样时间很快，如果是医务人员使用棉签现场采样，全程一般只用30秒时间。如果是采用大便标本送去病理检查的方式，可以自行控制时间。
肛拭子核酸结果在12~24小时内就可以拿到，而且不会比鼻咽拭子更让接受者感到疼痛。
但是，肛拭子检测可能会在心理上与生理上让接受检测者感到不舒服，造成困扰。所以目前肛拭子并没有普遍采用，仅针对重点的人群，如集中隔离的患者、与新冠肺炎患者密切接触的人员等。