根据个人不同的承受范围，鼻拭子采样带来的不适感各异，一般来说，只有稍许不适。
鼻拭子采样是将一根细长的鼻拭子伸进鼻腔中，旋转刮取鼻咽部粘膜壁的呼吸道分泌物以作后续分析。取样过程中，大部分人会感到鼻咽部稍有不适感，但并无大碍，一般在鼻拭子取出后都能迅速缓解，不会有持久和反复的不适，不影响正常的工作和生活。
采样时，要配合采样人员，保持平静，才能避免拭子探入过深或挤压到别的组织，减少不适。部分人群可能会因为鼻拭子刮取感到恶心呕吐，一般稍作休息都能得到恢复。