卵巢囊肿蒂扭转时治疗原则，首先要消除病因，尽量保留女性生育功能，其次要预防血栓形成。
卵巢囊肿发生完全性扭转时，附件区域的血运完全被中断。组织发生缺血、坏死，血栓形成，颜色发黑，此时如果将蒂部复位，可以引起栓子脱落，通常需要做附件的切除手术。
囊肿发生不完全扭转时，尚有部分血液供应卵巢以及输卵管。附件颜色有可能呈现暗红色，在蒂部复位之后，颜色逐渐转红，可以仅切除卵巢囊肿，保留卵巢正常排卵以及分泌激素的功能。