糖尿病与免疫系统是有关的。主要指的是一型糖尿病，二型糖尿病一般与免疫系统没有什么太大的关系。
而一型糖尿病理论上是属于一种自身免疫病的，由于自身免疫系统识别错误，导致身体里面产生了异常的可以攻击自身胰岛细胞的抗体，从而导致胰岛细胞被大量破坏以后，丧失分泌胰岛素的功。自身免疫问题在一型糖尿病的发病中起了相当重要的作用。
一型糖尿病与遗传有着密切的联系，此外，病毒感染，比如风疹病毒、腮腺病毒以及柯萨奇病毒，在一型糖尿病的发病中，也有着一定的作用。