巴雷特食管是指食管下端的复层鳞状上皮被化生的单层柱状上皮所替代的一种病理现象，可伴有肠化生或者不伴有肠化生。该病的鉴别主要是与反流性食管炎相鉴别，而鉴别的手段主要是通过典型的内镜下的表现，以及病理组织学分型来鉴别。巴雷特食管的典型的内镜下表现可分为三型，全周型，岛状和舌型。而他的组织学分型呢，也可以分为三型，分别是胃底型，贲门型和特殊肠化生型。
所以说，在内镜下如果观察到可疑巴雷特食管一定要多点取活检送病理来做到鉴别诊断。