胆总管结石有可能会掉入到肠内排出，往往是小结石在胆总管内比较容易通过胆总管开口排入到十二指肠内，在排石过程中病人可能会感觉到较为剧烈的胆绞痛。
小结石一般不引起胆管梗阻，但在排石过程中会刺激Oddi括约肌痉挛，造成胆总管出口处暂时性梗阻，有可能会引起短暂性的梗阻性黄疸和诱发急性胆源性胰腺炎。
大部分的胆总管结石不宜通过十二指肠排出，临床会较为明显的右上腹胆绞痛，伴有恶心、呕吐、腹泻、便秘等消化系统症状，还会伴有发热，甚至高热、寒战的症状。有可能会引起急性化脓性梗阻性胆管炎，往往需要急症行手术治疗。