胰腺囊肿的早期症状可能会出现没有明显的以及特征的临床表现，有时有可能会仅仅表现出腹部隐痛、腹胀、消化不良等症状。
胰腺囊肿在临床上最多见的类型是假性囊肿，这是继发于胰腺炎或者胰腺外伤后的并发症。
如果形成了囊肿较大，则有可能会表现出上腹部饱胀感以及持续性隐痛不适等症状，并且囊肿如果对周围器官压迫时，还有可能会引起相应的器官功能障碍。若继发感染时会引起发热、腹痛等表现，如果囊肿破裂消化液进入腹腔内，则有可能会引起严重的腹膜炎。