胆囊结石一般不会引起肝功能异常。
如果胆囊结石在检查过程中发现肝功能异常时，需要高度怀疑胆总管内有无病变，包括胆总管结石或者肿瘤的存在。其中胆总管内结石有可能是胆囊内小结石，经胆囊管进入胆总管内而形成，必要时需完善胆道造影、胆道核磁共振等相关检查明确诊断。
某些特殊的情况，如胆囊管与胆总管并行时，胆囊管内的结石有可能会对胆总管产生压迫，而导致胆总管内胆汁引流不畅，从而引起肝功能异常。这种情况通常称为胆囊MIRIZZI综合征，需要积极手术。